- Rengia Departamento biudžeto programų, nuompinigių už valstybės ilgalaikį materialųjį turtą, pervestų į valstybės biudžetą, sąmatų projektus;
- pagal kompetenciją rengia investicijų projektus ir teisės aktų nustatyta tvarka ir terminais teikia juos Ministerijos Ekonomikos ir finansų departamentui;
- derina ir pagal kompetenciją kartu su Įstaigomis kontroliuoja biudžeto programų lėšų ir kitų Įstaigose naudojamų lėšų sąmatas;
- teisės aktų nustatyta tvarka sudaro Departamento bei Įstaigų biudžeto vykdymo ataskaitas, finansinių ataskaitų rinkinius bei teikia jų duomenis Ministerijos Ekonomikos ir finansų departamentui;
- pagal kompetenciją rengia Departamento ir Įstaigų finansines ir kitas ataskaitas bei teikia jų duomenis suinteresuotoms valstybės institucijoms ir įstaigoms;
- vykdo Departamento ir Įstaigų valstybės tarnautojų ir darbuotojų, dirbančių pagal darbo sutartis, darbo užmokesčio ir kitų mokėtinų lėšų apskaičiavimą ir kontroliuoja jų savalaikį mokėjimą;
- vykdo atsiskaitymus su fiziniais ir juridiniais asmenimis už jų pateiktas prekes, suteiktas paslaugas ir atliktus darbus;
- pagal kompetenciją vykdo Departamento ir Įstaigų ūkinių operacijų išankstinę ir paskesniąją finansų kontrolę;
- organizuoja ir teisės aktų nustatyta tvarka dalyvauja vykdant kasmetinę Departamento turto inventorizaciją ir užtikrina savalaikį jos atlikimą;
- dalyvauja atliekant kasmetinę Įstaigų turto inventorizaciją.
- koordinuoja ir kontroliuoja valstybės biudžeto, Europos Sąjungos lėšų ir kitų lėšų panaudojimo, finansinių ir ūkinių operacijų atlikimo, finansinių dokumentų įforminimo atitiktį teisės aktų nustatytiems reikalavimams;
- organizuoja ir atlieka valstybės biudžeto, Europos Sąjungos lėšų ir kitų lėšų, turto pajamų bei išlaidų operacijų, išreikštų pinigais, registravimą Departamento ir Įstaigų apskaitos registruose bei grupavimą pagal teisės aktuose nustatytus apskaitos metodus finansinei atskaitomybei sudaryti;
- organizuoja mokėjimus pagal Departamento vardu sudarytas sutartis, finansuojamas iš valstybės biudžeto, Europos Sąjungos ir kitų lėšų, vykdo šių lėšų apskaitą ir pagal kompetenciją jų kontrolę.
- kaupia Lietuvos Respublikos valstybės kontrolės ir Ministerijos Centralizuoto vidaus audito skyriaus Departamente atliktų auditų ataskaitas, išvadas, rekomendacijas bei kitus su tuo susijusius dokumentus, rengia, derina išvadų ir rekomendacijų įgyvendinimo priemonių planų projektus, teikia juos tvirtinti Departamento direktoriui, koordinuoja ir užtikrina savalaikį audito išvadų ir rekomendacijų įgyvendinimo priemonių planų vykdymą, teikia auditą atlikusiai įstaigai informaciją apie šių planų įgyvendinimą;
- teikia siūlymus Departamento Viešųjų pirkimų skyriui prekių, paslaugų ir darbų viešųjų pirkimų planui parengti;
- pagal kompetenciją rengia ir teikia Departamento atsakingam asmeniui duomenis ir informaciją Departamento metinio veiklos plano, vidaus reikalų ministrui pavestų valdymo sričių strateginio veiklos plano projektų rengimui, dalyvauja šių planų vykdyme bei rengia ataskaitas apie priemonių įgyvendinimą;
- dalyvauja rengiant Lietuvos Respublikos vidaus reikalų ministro įsakymų, Ministerijos kanclerio potvarkių, Departamento direktoriaus įsakymų, Įstaigų vadovų įsakymų, kitų teisės aktų, sutarčių bei dokumentų, susijusių su finansine apskaita ir atskaitomybe, projektus;
- pagal kompetenciją derina ir vizuoja Departamento ir Įstaigų vardu sudaromų sutarčių, įsakymų ir kitų dokumentų, susijusių su finansine apskaita ir atskaitomybe, projektus;
- pagal kompetenciją kontroliuoja Departamento ir Įstaigų sudarytų sutarčių vykdymą;
- teikia siūlymus Departamento direktoriui dėl turto administravimo, kiek tai susiję su finansinės apskaitos funkcijų vykdymu;
- teikia konsultacijas Departamento ir Įstaigų valstybės tarnautojams ir darbuotojams, dirbantiems pagal darbo sutartis, finansinės apskaitos tvarkymo ir kitais finansiniais klausimais;
- pagal Skyriaus vykdomas funkcijas teisės aktų nustatyta tvarka įgyvendina vidaus kontrolės politiką, atlieka finansų kontrolės procedūras;
- pagal kompetenciją dalyvauja korupcijos prevencijos priemonių įgyvendinime;
- teisės aktų nustatyta tvarka parengia Skyriaus dokumentų bylas bei perduoda jas saugoti į archyvą;
- atlieka kitas teisės aktų nustatytas funkcijas, Departamento direktoriaus pavedimus, susijusius su Skyriaus veikla.